Convocatoria 2021 – «Projectes de Generación de Conocimiento»
introducció
El càncer és la segona causa de mort a tot el món (després de les malalties cardiovasculars), sent reconegut com una amenaça global. Els investigadors han fet grans avenços en l'aprenentatge de més detalls sobre com prevenir, diagnosticar i tractar el càncer. No obstant això, es desconeixen molts aspectes d'aquesta malaltia complexa i polifacètica. La investigació multidisciplinària que combina el modelatge matemàtic amb dades reals en aquesta àrea esdevé essencial per entendre com els tumors creixen, evolucionen i evaden pressions selectives com el sistema immunitari (SI) o les teràpies. La complexitat dels tumors comporta un gran nombre de preguntes com ara com heterogeneïtat i l'estocasticitat afecta les cèl·lules canceroses proliferació, l'acció de l'IS sobre ells i l'evasió de les teràpies anticancerígenes. Aquestes característiques s'aborden en aquesta proposta en el marc de teoria de sistemes dinàmics i modelització multiescala aplicada a evolució del càncer i teràpies anticancerígenes.
L'heterogeneïtat és una de les principals causes de resistència als tractaments dirigits en la terapèutica del càncer. Una distribució diversa de cèl·lules tumorals fenotípicament diferents abans del tractament amb fàrmacs predisposa a respostes no uniformes, donant lloc a l'eliminació de cèl·lules cancerígenes sensibles alhora que deixa il·leses les subpoblacions resistents. Hi ha una àmplia evidència de diversitat genètica entre les cèl·lules canceroses tant dins dels tumors com entre ells, sent la inestabilitat genòmica el principal motor de l'heterogeneïtat. Tanmateix, ara és evident que la variabilitat genètica per si sola no explica tota la variació de les respostes als fàrmacs anticancerígens dirigits. L'heterogeneïtat no genètica té diverses fonts: epigenètica, estocàstica i ambiental. Aquestes fonts d'heterogeneïtat poden produir diversitat fenotípica fins i tot en cèl·lules genèticament idèntiques. No és sorprenent que l'anàlisi de les conseqüències de la variabilitat no genètica de cèl·lula a cèl·lula en la resposta cel·lular als fàrmacs i el seu impacte potencial per al tractament de malalties humanes, inclòs el càncer, s'ha convertit en un tema crucial per entendre els fenòmens de resistència als medicaments i desenvolupar nous objectius. agents.
L'objectiu general d'aquest projecte és desenvolupar encara més la nostra investigació sobre el paper de l'heterogeneïtat en el càncer, identificant vies i mecanismes de resistència al tractament i, finalment, avaluar el disseny racional de teràpies combinatòries amb fàrmacs existents i prescriure noves estratègies terapèutiques per superar els efectes de l'heterogeneïtat. Amb aquesta finalitat, aplicarem diverses tècniques matemàtiques, que van des de la teoria de sistemes dinàmics fins al modelatge híbrid multiescala. Aquestes tècniques ens permetran abordar qüestions relacionades amb la generació de comportament heterogeni en tumors (degradació dels paisatges epigenètics (EL) i angiogènesi induïda per tumors), el seu paper en la immunoedició, com l'heterogeneïtat de les cèl·lules canceroses afecta els resultats de la immunoteràpia i la viroteràpia oncolítica. , i els efectes del soroll en els processos autocatalítics en càncer.
OBJECTIUS
a. Investigar dinàmiques i bifurcacions en processos autocatalítics en la proliferació de cèl·lules canceroses, és a dir, senyalització autocrina i autocrina-paracrina, considerant l'estocasticitat i l'espai explícit.
b. Formular models per investigar les transicions globals en paisatges epigenètics (EL) i dilucidar els papers tant de l'heterogeneïtat en els cofactors metabòlics com de l'estocasticitat en l'erosió dels ELs de funció robusta. Proposar estratègies per a la restauració d'ELs funcionals en càncer i envelliment.
c. Modeleu l'acoblament mecanoquímic en l'angiogènesi induïda per tumors i investigueu com la seva desregulació contribueix al lliurament heterogeni d'oxigen. Avaluar la viabilitat d'aquest acoblament com a diana terapèutica.
d. Investigar l'evolució de la immunogenicitat de les cèl·lules canceroses que interactuen amb les cèl·lules IS i els processos clau que permeten evitar el sistema immunitari.
e. Formular models experimentals de cèl·lules canceroses metabòlicament heterogènies i la seva interacció amb les cèl·lules immunitàries per dilucidar estratègies de combinació òptimes de modificadors metabòlics amb fàrmacs immunoterapèutics (com ara fàrmacs antipunt de control).
f. Modelar la dinàmica dels experiments amb virus oncolítics transgènics per buscar bifurcacions i escenaris de deteriorament del tumor. Els models s'utilitzaran per optimitzar l'eficàcia d'aquesta teràpia.
g. Amplieu la nostra xarxa actual de col·laboracions i arribeu a la comunitat de metges clínics. Amb aquesta finalitat, tenim previst dur a terme un Programa de Recerca Intensiva i fer seminaris i reunions amb el personal de l'Hospital Clínic de Barcelona i l'Hospital Dr Trueta de Girona.
investigadors principals
Lloc web personal
Tomàs Alarcón
ICREA – CRM
talarcon@crm.cat
Vaig obtenir el meu doctorat en Física Teòrica per la Universitat de Barcelona l'any 2000. Després d'això vaig passar molts anys meravellosos treballant com a postdoctoral a la Universitat d'Oxford, Regne Unit (2001-2003), University College London, Regne Unit (2003-2006), i Imperial College London, Regne Unit (2006-2009). Vaig ocupar breument un càrrec d'investigador sènior i líder de grup a BCAM, Bilbao, Espanya (2009-2010), després de la qual em vaig traslladar al Centre Recerca Matemàtica on dirigí el Grup de Modelització del Càncer. També he realitzat beques de visita a la Universidad Complutense de Madrid, IIMAS (UNAM, Mèxic DF), OCCAM (Universitat d'Oxford, Regne Unit), el Mathematical Institute (Universitat d'Oxford, Regne Unit) i el Mathematical Biosciences Institute (Columbus, Ohio). , EUA). L'octubre de 2015 vaig ser nomenat professor de recerca ICREA al Centre de Recerca Matemàtica.
Lloc web personal
Josep Sardanyés
CRM
jsardanyes@crm.cat
Vaig cursar la llicenciatura en Biologia a la Universitat de Barcelona (2002) i vaig obtenir un Màster i un Doctorat en Biomedicina (2009) al Complex Systems Lab (CSL, Universitat Pompeu Fabra). Durant la meva tesi doctoral vaig treballar els sistemes dinàmics i la complexitat en biologia. En obtenir el meu títol de doctor, em vaig traslladar a València on vaig ocupar una plaça postdoctoral a l'Institut de Biologia Molecular i Cel·lular Vegetal (Consejo Superior de Investigaciones Científicas-UPV). El 2011 em vaig traslladar als Instituts David J. Gladstone per a un segon postdoctorat (Universitat de Califòrnia San Francisco, EUA), on em vaig centrar en la dinàmica evolutiva del virus ARN. Després, vaig tornar a traslladar-me al CSL on vaig realitzar un tercer postdoctorat (2012-2016) treballant sobre l'evolució del càncer, l'ecologia i sistemes teòrics i la biologia sintètica. L'any 2017 em vaig convertir en investigadora del CRM.