Filogenètica algebraica i combinatòria
Filogenètica algebraica i combinatòria
Veure programació.
- Geometria algebraica, simplèctica i aritmètica (Marta Casanellas)
- Probabilitat i estadística (Gábor Lugosi)
- Laboratori d'Algorítmica Relacional, Complexitat i Aprenentatge (Ricard Gavaldà)
registre
Per a la inscripció i l'enviament del cartell, ompliu-ho forma.
L'única restricció de mida d'un pòster és que la pantalla del pòster no ha de ser superior a 1 metres d'amplada x 2 de llargada.
Si ja us heu registrat, podeu procedir al pagament seguint els enllaços:
Hi haurà un número especial de la Butlletí de Biologia Matemàtica sobre Mètodes Algebraics en Filogenètica. Els participants del programa mensual BGSMath estan convidats a enviar els seus treballs. Per a més detalls, clica aquí.
El termini per inscriure's és De maig de 31st, 2017.
Si us plau, tingueu en compte que Barcelona està molt plena a l'estiu, així que reserveu el vostre allotjament el més aviat possible.
Aquí hi ha una llista de possibles hotels i residències que poden ajudar.
Presentation
Aquest programa no només busca aplicacions interdisciplinàries de les matemàtiques, sinó que també busca interaccions intradisciplinàries. Encara que és més o menys conegut que l'estadística, la probabilitat, la computació, les equacions diferencials i l'algorítmica tenen un paper important en la biologia, la bioestadística i la bioinformàtica, probablement és menys evident que àrees com la combinatòria, la geometria i l'àlgebra també puguin interactuar amb la biologia. La combinatòria sempre ha estat una part important de la filogenètica, sobretot perquè l'ús de xarxes ha demostrat ser rellevant en aquest camp. L'àlgebra i la geometria han aparegut en filogenètica a través de la nova disciplina "estadística algebraica".
Continguts del programa
Durant els darrers deu anys s'ha observat un gran progrés en l'estudi i disseny de models matemàtics i mètodes de reconstrucció filogenètica. Una gran part d'aquest desenvolupament es deu a l'àlgebra i la combinatòria. Per resumir aquest progrés i comunicar-lo a un públic matemàtic més ampli, és important organitzar un programa on els matemàtics (que treballen en àlgebra, combinatòria, geometria, computació, algorítmica, probabilitat o estadística) i biòlegs puguin presentar els principals èxits en aquest camp.
L'objectiu principal d'aquest programa és doble: a despertar l'interès dels matemàtics per la recerca aplicada en biologia, I per reunir matemàtics de diferents disciplines. Per tant, el programa serà tant interdisciplinari com intradisciplinari.
Proposem l'organització de dos cursos, una centrada aspectes combinatoris de filogenèticai l'altre més orientat algebraicament. El programa es conclourà amb un taller.
Creiem que això ofereix una bona oportunitat per a aquells estudiants de doctorat i postdoctorats que realitzen investigacions en àrees relacionades sense cap coneixement previ de filogenètica, i, alhora, per als investigadors sèniors que estiguin interessats a obrir el ventall d'aplicacions de la seva recerca i aprendre noves eines i enfocaments.
Els dos cursos serien impartits per figures destacades en aquests camps de recerca, que han confirmat la seva participació: Mike Steel (Universitat de Canterbury, Christchurch NZ), Arndt von Haeseler (Centre de Bioinformàtica Integrativa de Viena) i Piotr Zwiernik (Universitat Pompeu Fabra)
Objectius
- Donar a conèixer les eines algebraiques i combinatòriques utilitzades en filogenètica als estudiants de doctorat, postdoctorants i investigadors sèniors que treballen en aquestes àrees.
- Difondre i explicar les eines matemàtiques entre els bioinformàtics.
- Conèixer els resultats assolits recentment en filogenètica, amb especial èmfasi en la diversitat d'eines matemàtiques i estadístiques que es podrien utilitzar.
- Enfortir els llaços entre diferents grups de recerca en temes similars aquí i fora de Catalunya.
- Augmentar la interacció entre bioinformàtics i matemàtics que treballen a Barcelona.
- Atreure nous estudiants de doctorat a aquest camp interdisciplinari.
- Crear un grup de treball interdisciplinari a Barcelona amb investigadors que treballin en diferents camps
Planificació i programació
Curs de Mike Steel i Arndt von Haeseler sobre Filogenètica i combinatòria (19 -23 de juny):
Conferència 1 Introducció a la filogenètica (Arndt); Combinatòria bàsica d'arbres discrets (Mike)
Conferència 2 Filogènies contínues i reconstrucció a distància (Arndt); Filogènies basades en caràcters discrets (Mike)
Conferència 3 Evolució en un arbre (primera part) (Arndt); Forma d'arbre i filogènies discretes aleatòries (Mike)
Conferència 4 Evolució en un arbre (part 2) (Ardnt); Evolució dels arbres (Mike)
Conferència 5 Supertrees i Supermatrices: (Ardnt); Xarxes filogenètiques (Mike)
https://sites.google.com/view/acphyl2017/week-1?authuser=0
Setmana 2
Taller de filogenètica algebraica i combinatòria (Juny 26-30)
Setmana 3
Curs de Piotr Zwiernik curs sobre Estadístiques semialgebraiques, models d'arbres latents i filogenètica (3-7 de juliol):
Lliçó 1: Arbres, mètrica de l'arbre i espais arbrat
Lliçó 2: Models gràfics d'arbres latents
Tema 3: Inferència i estimació d'arbres
Tema 4: Estimació de paràmetres
Conferència 5: Submodels especials