La Junta Directiva és l'òrgan encarregat d'assessorar i donar suport en la planificació, organització i gestió del centre. Està integrat, a proposta del director, pels investigadors següents:

Josep Álvarez (UPC) – Responsable de la Unitat de Formació BGSMath

Marcel Guardia (UB) – Director Científic del Centre de Recerca Matemàtica

Joaquim Ortega (UB) – Responsable d'Activitats de Recerca

Joan Porti (UAB) – Responsable de Programes de Visites

Klaus Wimmer (CRM) – Responsable de comunicació i divulgació